《系统科学与数学》为国内的核心期刊，被国内外重要数据库或权威性文摘期刊广泛收录，包括：
美国 Current Mathematical Publications
美国 Mathematical Reviews
俄罗斯 Abstract Journals
日本《科学技术文献速报》
德国 Zentralblatt für Mathematik
《中国学术期刊文摘》
《中国数学文摘》
中国科学引文数据库
清华学术期刊光盘版
万方数据库
“Journal of Systems Science and Complexity”为国内的核心期刊，被国内外重要数据库或权威性文摘期刊广泛收录，包括：
美国 Science Citation Index Expanded
美国 Current Mathematical Publications
美国 Mathematical Reviews
俄罗斯 Abstract Journals
德国 Zentralblatt für Mathematik
英国 INSPEC
《中国学术期刊文摘》
《中国数学文摘》
中国科学引文数据库